靶向菌群的气雾剂，有望用于防治肺部肿瘤 | 热心肠日报

今天是第895期日报。

Cell子刊：抗生素和益生菌有望用于防治肺转移肿瘤

Cell Reports[IF:8.032]

① 肺菌群可促进肺部形成免疫耐受微环境；② 万古霉素/新霉素雾化治疗，减少小鼠肺部细菌数量，减少调节性T细胞、增强T效应细胞和NK细胞活性，抑制黑色素瘤的肺转移，移植经抗生素治疗的肺部分离菌也有此效；③ 鼠李糖乳杆菌雾化治疗，促进小鼠肺部抗原提呈细胞成熟、减少耐受性微环境，从而增强肺部效应细胞的抗肿瘤免疫；④ 二者都可增强化疗药物达卡巴嗪的疗效；⑤ 益生菌或抗生素的雾化吸入治疗用于防治肺转移肿瘤，有临床运用前景。

Modulation of Pulmonary Microbiota by Antibiotic or Probiotic Aerosol Therapy: A Strategy to Promote Immunosurveillance against Lung Metastases

09-25  DOI: 10.1016/j.celrep.2018.08.090

Science子刊：分析化学梯度对肺部菌群的影响，有望带来新疗法

Science advances[IF:11.511]

① 用WinCF微生物发酵系统分析18例囊性纤维化（CF）患者的痰液样本；② pH和氧气梯度可将患者菌群成员划分为两个互斥的类群：偏好富氧和高pH环境的非发酵性的致病菌，以及存在于低氧和低pH环境中的发酵性厌氧菌；③ 抗生素杀死特定致病菌，可引起菌群的复杂应答，包括改变抗生素化学结构从而产生抗性，以及菌群整体结构的变化导致其它致病菌占据死掉细菌的生态位；④ 建立数学模型，可用于预测干预疗法对CF患者菌群的影响。

Niche partitioning of a pathogenic microbiome driven by chemical gradients

09-26  DOI: 10.1126/sciadv.aau1908

Cell子刊：肠道菌群与溃疡性结肠炎的程度和疗效相关

Cell Host and Microbe[IF:17.872]

① 纳入405例新发病、未经治疗的小儿溃疡性结肠炎（UC）患者，分析基线和接受治疗1年中的粪便菌群与病程的关联；② 基线的菌群特征与疾病严重程度和进展均相关，患者血清中的抗微生物抗体水平，与菌群特征和疾病严重性相关；③ 在严重患者中，以梭菌目（如瘤胃菌科和毛螺菌科）为代表的43个OTU显著减少，而7个增多的OTU均为口腔细菌；④ 治疗过程中菌群的纵向变化与疗效有关，肠道中口腔细菌（特别是副流感嗜血杆菌）的减少伴随着疾病的缓解。

Compositional and Temporal Changes in the Gut Microbiome of Pediatric Ulcerative Colitis Patients Are Linked to Disease Course

10-10  DOI: 10.1016/j.chom.2018.09.009

Nature子刊：NIK信号轴在肠道免疫及稳态中的重要作用

Nature Immunology[IF:21.809]

① 非经典NF-κB诱导激酶（NIK）是粘膜树突细胞（DC）功能的关键调节因子；② DC特异性NIK缺失损害肠道IgA的分泌和菌群稳态，导致小鼠对肠道病原体柠檬酸杆菌敏感；③ 肠上皮细胞中IgA转运蛋白pIgR的表达需要DC特异性NIK，并依赖于Th17细胞和天然淋巴细胞（ILC）产生的IL-17；④ NIK激活的非经典NF-κB诱导DC中IL-23的表达，有助于维持Th17细胞和ILC3；⑤ 另一方面，NIK的缺失可缓解诱导的小鼠结肠炎。

NIK signaling axis regulates dendritic cell function in intestinal immunity and homeostasis

09-24  DOI: 10.1038/s41590-018-0206-z

促炎肠道菌群可加速动脉粥样硬化

Circulation Research[IF:15.211]

① 抗生素处理的Ldlr-/-小鼠（高血脂和动脉粥样硬化动物模型），经同笼饲养获得Casp-/-小鼠的促炎肠道菌群（LC）或同种小鼠的肠道菌群（LL）；② 高脂高胆固醇饮食下，LC小鼠动脉粥样硬化斑块显著大于LL小鼠；③ 血液白细胞、斑块内的中性粒细胞、血液促炎细胞因子增多；④ 粪便中短链脂肪酸（SCFA）产生菌减少，盲肠SCFA浓度降低，但不影响血液氧化三甲胺水平和肠道屏障功能；⑤ 促炎菌群可增加Ldlr-/-小鼠的系统性炎症，加速动脉粥样硬化形成。

A Pro-Inflammatory Gut Microbiota Increases Systemic Inflammation and Accelerates Atherosclerosis

10-03  DOI: 10.1161/CIRCRESAHA.118.313234

苏大一院：粪菌移植治疗胃肠道急性移植物抗宿主病

Frontiers in Immunology[IF:5.511]

① 类固醇难治性胃肠道（GI）移植物抗宿主病（GvHD）患者预后较差，治疗方案有限；② 纳入8名类固醇难治性GI-GvHD患者，评估粪菌移植（FMT）的有效性和安全性；③ 接受FMT后，所有患者的临床症状均得到改善，肠道菌群的多样性及组成恢复正常，厚壁菌门/拟杆菌门比值恢复正常，未见明显不良反应；④ 与未接受FMT的患者相比，这8位病人的无进展生存期更长，总生存期无显著差异；⑤ FMT可作为GI-GvHD的备用治疗方案，其有效性和安全性需进一步评估。

Treating steroid refractory intestinal acute graft-versus-host disease with fecal microbiota transplantation: a pilot study

09-05  DOI: 10.3389/fimmu.2018.02195

中科院邓晔：野生动物保护需考虑环境对肠道菌群的影响

Scientific Reports[IF:4.122]

① 鸿雁从人类活动程度较低的繁殖区迁徙到人群活动较频繁的越冬区，粪便细菌和真菌菌群发生变化；② 两地鸿雁粪便菌群的总体组成、α多样性、功能预测谱和核心菌群有一定相似性，但β多样性、物种丰度和互作网络结构有显著差异；③ 越冬区粪便菌群中，外源化合物降解以及疾病相关通路上调，致病菌丰度增加；④ 鸿雁肠道菌群在长途迁徙后有所改变，但核心菌群保持稳定；⑤ 栖息地环境压力，如环境污染，可能通过改变肠道菌群间接威胁野生动物。

Habitat environments impacted the gut microbiome of long-distance migratory swan geese but central species conserved

09-06  DOI: 10.1038/s41598-018-31731-9

新方法为微生物修复带来新的希望

Critical Reviews in Biotechnology[IF:5.239]

① 微生物修复是一种稳定、环境友好的污染治理方法，但其具有适应性差、耗时、竞争力弱和生物利用度低的弱点；② 系统生物学可利用多组学手段，从分子到生态系统不同维度，整合明晰微生物修复过程中的代谢通路与作用机理；③ 代谢工程学在明晰机理的基础上，通过基因克隆、编辑等手段增强或重构代谢通路，从而最终克服微生物修复的弱点；④ 不过，在环境中应用基因改造微生物时要注意可能的生态安全问题（如基因污染）。

Bioremediation through microbes: systems biology and metabolic engineering approach

09-09  DOI: 10.1080/07388551.2018.1500997

感谢本期日报的创作者：fang fang，mildbreeze，女巫，MAY DAY，熙子，米见对

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